该平台是我国科研院所中唯一一个向社会提供系统的环境基因组技术服务的实验室，拥有一台Illumina MiSeq二代测序仪，一台PacBio Sequel第三代测序仪。本平台还拥有大型服务器数台及与基因组、转录组分析相关的生物信息软件等，其下属的分子生物学实验室拥有完备的分子生物学研究用仪器和设备，如PCR仪、定量PCR、DNA片段化仪、DNA检测设备等。可开展（宏）基因组、转录组、扩增子测序及生物信息服务。开放网址：http://lxzgroup.cib.cas.cn/。

主要服务内容：

1. 宏基因组和基因组测序：对生物样品的基因组进行测序，获得基因组的序列信息。生物信息处理主要包括短序列的拼接、基因功能注释、数据的环境生物学意义解析等

2. 宏转录组和转录组测序：对生物样品的RNA组成进行测序，鉴定基因的表达情况，如RNA-seq分析

3. 扩增子测序：环境样品的单基因扩增子测序，主要是利用MiSeq平台对16S rRNA、18S rRNA、ITS等进行测序。在获得高质量的DNA样品后，由专业人员进行PCR扩增及上机测序，获得环境样品中微生物组成和多样性信息

4. 细菌基因组扫描图和完成图：对细菌基因组进行调查性测序，确定重要功能基因的序列和结构；结合二代与三代PacBio测序技术,对细菌的全基因组进行测序和生物信息分析、基因功能注释，建立基因组完成图

5. 生物信息处理：RNA-Seq分析、基因组拼接、重测序分析、宏基因组数据分析、微生物群落结构分析等

6. 技术培训：对有需求的研究人员进行单独的技术培训，如高通量测序、分子生物学技术、生物信息方法、生态统计学分析方法等

利用本平台开展工作的部分单位

中国科学院微生物研究所、中国科学院植物研究所、中国科学院青藏高原研究所、中国科学院南京土壤所、中国农业科学院、中国林业科学院、南京农业大学、中国科学院大学、清华大学、厦门大学、江南大学、 广东微生物研究所、中国地质大学（武汉）、天津师范大学、北京师范大学、中国科学院沈阳应用生态所等。